Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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