Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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