Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC024978J3QPC3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC024978J3QPC3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms