Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms