Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms