Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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