Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Clrn2B2RVW2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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