Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scn7aB1AYL1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn7aB1AYL1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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