Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Spocd1B1ASB6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Spocd1B1ASB6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Spocd1B1ASB6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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