Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms