Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccdc163A2AGD7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms