Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3550W4VSN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms