Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms