Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms