Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psma4Q9R1P0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms