Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Prg4Q9JM99 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Prg4Q9JM99 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Prg4Q9JM99 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Prg4Q9JM99 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Prg4Q9JM99 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prg4Q9JM99 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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