Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Col5a3Q9JLI2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col5a3Q9JLI2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1686 ms