Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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