Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trim39Q9ESN2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Trim39Q9ESN2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Trim39Q9ESN2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trim39Q9ESN2 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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