Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ube3bQ9ES34 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3bQ9ES34 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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