Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn2Q9ER65 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms