Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn23Q9D7D7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn23Q9D7D7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms