Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc83Q9D4V3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms