Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PclafQ9CQX4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms