Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms