Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms