Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Chmp3Q9CQ10 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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