Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms