Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rims1Q99NE5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rims1Q99NE5 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms