Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hdac9Q99N13 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac9Q99N13 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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