Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd1Q99MV1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms