Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms