Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf144aQ925F3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf144aQ925F3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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