Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssh3Q8K330 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms