Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Abcf3Q8K268 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Abcf3Q8K268 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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