Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SbsnQ8CIT9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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