Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Card11Q8CIS0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms