Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nedd4lQ8CFI0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Nedd4lQ8CFI0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Nedd4lQ8CFI0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Nedd4lQ8CFI0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Nedd4lQ8CFI0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Nedd4lQ8CFI0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nedd4lQ8CFI0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Nedd4lQ8CFI0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms