Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms