Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chic1Q8CBW7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 AC153364.1-201ENSMUST00000220081 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm12475-201ENSMUST00000119476 1389 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chic1Q8CBW7 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms