Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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