Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp20Q8C6M1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms