Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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