Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ctdsp2Q8BX07 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ctdsp2Q8BX07 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ctdsp2Q8BX07 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ctdsp2Q8BX07 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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