Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdcl3Q8BVF2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms