Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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