Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15708-201ENSMUST00000156467 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ClmQ7TSN2 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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