Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim12Q78RX3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms