Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp49Q6P9L4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp49Q6P9L4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms