Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itga7Q61738 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Itga7Q61738 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms